Theo chủ trương chung của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM về việc chuẩn hóa các chương trình đào tạo đại học và sau đại học theo các tiêu chuẩn quốc tế, Khoa Sinh học – Công nghệ Sinh học Trường ĐH Khoa học Tự nhiên đã triển khai đánh giá chương trình đào tạo Thạc sĩ ngành Công nghệ Sinh học theo tiêu chuẩn AUN-QA (ASEAN University Network - Quality Assurance)

Sau đợt giá chính thức vào tháng 11/2018 bởi các chuyên gia của AUN-QA, chương trình đào tạo Thạc sĩ ngành Công nghệ Sinh học đã chính thức được công nhận đạt chuẩn kiểm định chất lượng chương trình đào tạo theo AUN-QA